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Linking the resistome and plasmidome to the microbiome

Hi-C將耐藥基因組和質(zhì)粒基因組與宿主微生物基因組關(guān)聯(lián)

期刊:The ISME JournalIF10.3

時間:2019.5.30

主要內(nèi)容primary coverage

研究者構(gòu)建了兩類廢水樣本,1份不做處理命名為WW1份添加了E. coli,該菌株含有多重耐藥質(zhì)粒命名為WWEC。兩份樣本分別進行宏基因組和Hi-C分析,Hi-C數(shù)據(jù)分別將2份樣本的宏基因組組裝的contigs聚類得到1000個以上clusters,其中分別有51WW)和38WWEC)個clusters的組裝完整性高于80%Hi-C數(shù)據(jù)能夠重現(xiàn)多重耐藥質(zhì)粒與其宿主間的關(guān)系。


圖片 3.png





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